Ο σκοπός του Έργου «ECOeDNA» είναι να αναπτυχθεί μια νέα ερευνητική υποδομή που θα αξιοποιεί καινοτόμες μοριακές τεχνολογίες για την ανάλυση του περιβαλλοντικου DNA (eDNA), όσον αφορά την καταγραφή́ και την παρακολούθηση της δυναμικής και της ποικιλομορφίας των τοπικών αλιευμάτων και του θαλάσσιου μικροβιώματος.
Οι παραδοσιακές μέθοδοι παρακολούθησης των οικοτύπων και των ιχθυαποθεμάτων έχουν περιορισμούς εξαιτίας α) περιορισμών δειγματοληψίας, β) ετερογένειας και πολυπλοκότητας στα υδάτινα συστήματα, γ) πληθυσμιακής δυναμικής και δ) έντασης εργασίας και χρόνου που απαιτεί η ανάλυση των δειγμάτων. Τα διάφορα μοντέλα αξιολόγησης των αποθεμάτων χρειάζονται δεδομένα βάσει ηλικίας για τα αλιεύματα και τη δημογραφική δομή των πληθυσμών, τα οποία δεν είναι πάντοτε διαθέσιμα ή είναι ανακριβή. Πολλά από τα αποθέματα που υφίστανται εκμετάλλευση παραμένουν περιορισμένα, δεν αξιολογούνται ή αξιολογούνται βάσει αδύναμων παραδοχών για τη δομή και την οριοθέτησή τους.
Γι΄αυτό το λόγο χρειάζεται μια καινοτόμος, βαθύτερη, γρηγορότερη, ακριβέστερη και οικονομικότερη προσέγγιση για την αξιόπιστη παρακολούθηση των οικοτόπων και των ιχθυοαποθεμάτων, χρησιμοποιώντας τεχνολογίες αιχμής, με χαμηλό́ κόστος αλλά́ με υψηλή́ ακρίβεια και ευαισθησία. Για την επίτευξη της αξιολόγησης των ιχθυοαποθεμάτων, των οικοτύπων, καθώς και τη διαχείριση των πόρων των υδάτινων οικοσυστημάτων, θα χρησιμοποιηθεί η ανάλυση του eDNA. Οι εφαρμογές ανάλυσης eDNA πλέον προσφέρουν αξιοποιήσιμες πληροφορίες για τη διαχείριση των πόρων των υδάτινων οικοσυστημάτων, κυρίως αυξάνοντας την ταχύτητα και την ακρίβεια των αξιολογήσεων των ιχθυοαποθεμάτων και των οικοτύπων. Το eDNA σε συνδυασμό με αναλύσεις βιοπληροφορικής, μπορεί να προσφέρει σειρά πλεονεκτημάτων στα προγράμματα θαλάσσιας παρακολούθησης και αξιολόγησης σε σχέση με τις παραδοσιακές μεθόδους, με πολύ υψηλό λόγο απόδοσης δείγματος/κόστος.
Ταυτόχρονα, θα αναλυθεί ο πλούτος της μικροβιακής κοινότητας και των ειδών που υπάρχουν στο υδάτινο οικοσύστημα, παρέχοντας ένα εργαλείο απεικόνισης της ποικιλομορφίας των υδάτων. Επομένως θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί́ το μικροβίωμα και το eDNA ως ένα ευαίσθητο και οικονομικό́ εργαλείο ανίχνευσης της κλιματικής αλλαγής στους οικοτόπους.
Στόχος του «ECOeDNA» είναι:
- Να ενισχυθούν οι υφιστάμενες υποδομές και η σχετική τεχνογνωσία προκειμένου να αξιοποιηθεί η μέθοδος ανάλυσης του μικροβιώματος και του eDNA για την εκτίμηση των οικοτύπων σε υδάτινα συστήματα.
- Δημιουργία βιοτράπεζας.
- Να αναλυθεί ο πλούτος της μικροβιακής κοινότητας και των ειδών που υπάρχουν στο υδάτινο οικοσύστημα μέσω της καταλογογράφησης του γενετικού υλικού που θα ανιχνευτεί.
- Να χρησιμοποιηθεί το μικροβίωμα και το eDNA ως ένα ευαίσθητο και οικονομικό εργαλείο ανίχνευσης της επίπτωσης των περιβαλλοντολογικών και ανθρωπογενών πιέσεων.
Το έργο διαρθρώνεται στα εξής πακέτα εργασίας (ΠΕ):
